Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms