Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms