Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms