Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp53P15975 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms