Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnmt1P13864 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnmt1P13864 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 996.5 ms