Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms