Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AppP12023 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AppP12023 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AppP12023 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AppP12023 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AppP12023 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AppP12023 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AppP12023 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AppP12023 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AppP12023 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AppP12023 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AppP12023 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms