Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fv4P11370 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms