Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spp1P10923 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms