Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P10404 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P10404 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P10404 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P10404 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P10404 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P10404 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P10404 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P10404 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P10404 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P10404 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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