Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NeflP08551 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeflP08551 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeflP08551 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NeflP08551 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NeflP08551 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeflP08551 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NeflP08551 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeflP08551 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeflP08551 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NeflP08551 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeflP08551 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms