Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr1P08046 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Egr1P08046 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Egr1P08046 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms