Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms