Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrlP06879 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrlP06879 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrlP06879 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrlP06879 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrlP06879 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrlP06879 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrlP06879 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrlP06879 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrlP06879 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrlP06879 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms