Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms