Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06344 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06344 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06344 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06344 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06344 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06344 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06344 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P06344 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06344 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06344 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms