Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcrg-V1P06325 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms