Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa3P02831 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms