Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms