Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01803 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01803 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01803 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01803 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01803 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01803 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01803 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01803 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01803 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01803 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01803 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms