Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01796 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01796 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01796 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01796 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01796 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01796 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01796 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms