Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01673 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01673 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01673 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01673 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01673 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01673 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01673 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01673 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01673 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01673 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01673 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01673 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01673 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01673 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01673 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01673 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01673 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms