Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01663 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01663 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01663 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01663 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01663 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01663 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01663 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms