Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms