Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tcn2O88968 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms