Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JtbO88824 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JtbO88824 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JtbO88824 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JtbO88824 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JtbO88824 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms