Protein–RNA interactions for Protein: O88796

Rpp30, Ribonuclease P protein subunit p30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp30O88796 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpp30O88796 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpp30O88796 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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