Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BlmO88700 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BlmO88700 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BlmO88700 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BlmO88700 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BlmO88700 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BlmO88700 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BlmO88700 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BlmO88700 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BlmO88700 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BlmO88700 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BlmO88700 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BlmO88700 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BlmO88700 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BlmO88700 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BlmO88700 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BlmO88700 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BlmO88700 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BlmO88700 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BlmO88700 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BlmO88700 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BlmO88700 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BlmO88700 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BlmO88700 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BlmO88700 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BlmO88700 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BlmO88700 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BlmO88700 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BlmO88700 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BlmO88700 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BlmO88700 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms