Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a2O88627 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a2O88627 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms