Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng2O88602 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms