Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops3O88543 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms