Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms