Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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