Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CaskO70589 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CaskO70589 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CaskO70589 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CaskO70589 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CaskO70589 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CaskO70589 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CaskO70589 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CaskO70589 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms