Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xirp1O70373 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xirp1O70373 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms