Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms