Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd70O55237 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd70O55237 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms