Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

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Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtogO55225 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtogO55225 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtogO55225 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtogO55225 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OtogO55225 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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OtogO55225 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
OtogO55225 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtogO55225 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtogO55225 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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