Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26a1O55127 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms