Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrxO55103 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrxO55103 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrxO55103 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrxO55103 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrxO55103 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrxO55103 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PrxO55103 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PrxO55103 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrxO55103 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrxO55103 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrxO55103 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrxO55103 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrxO55103 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrxO55103 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrxO55103 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrxO55103 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrxO55103 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrxO55103 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrxO55103 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrxO55103 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrxO55103 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrxO55103 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrxO55103 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PrxO55103 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms