Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb2O55029 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb2O55029 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb2O55029 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms