Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SlkO54988 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SlkO54988 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SlkO54988 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlkO54988 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlkO54988 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlkO54988 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SlkO54988 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SlkO54988 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SlkO54988 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SlkO54988 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SlkO54988 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SlkO54988 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SlkO54988 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SlkO54988 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SlkO54988 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SlkO54988 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms