Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pole2O54956 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole2O54956 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms