Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf12O54907 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms