Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb3O54890 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms