Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbrO54799 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbrO54799 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbrO54799 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbrO54799 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbrO54799 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms