Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DffaO54786 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DffaO54786 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DffaO54786 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DffaO54786 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DffaO54786 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DffaO54786 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DffaO54786 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DffaO54786 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DffaO54786 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DffaO54786 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DffaO54786 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DffaO54786 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DffaO54786 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms