Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sdc4O35988 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdc4O35988 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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