Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf18O35714 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf18O35714 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms