Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TnxbO35452 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms